目前，我國的制藥機械制造業基本處于國際先進水平。但在安全方面卻暴露出一系列社會影響嚴重的事故問題。在這其中，除去少數企業為尋求私利以次充好之外，制藥加工中，工藝流程上出現的加工機械間接污染也成為了嚴重影響國民身體健康的重要殺手。
因為毒膠囊、農殘留等令人不寒而栗事件的曝光，藥品安全問題又一次觸動了國人早已繃得很緊的神經。近年來，人們關注自身安全的同時，也越來越多地關注到了藥品的安全，卻忽視了制藥加工機械、器具。事實上，與其他相比，制藥機械對藥品安全的影響范圍和數量更大，因為它可能多批次、大量的持續污染藥品，威脅藥品的安全。
制藥機械作為在加工過程中與食品進行多方面親密接觸的設備，其安全可靠性卻長期以來受到社會忽視。一是不及時消毒。對生產線上的機械進行徹底清洗消毒必然要使生產作業停止，是很多企業所不愿意的;另外制藥加工機械設計不合理，不利于清洗，存在死角也是一方面很重要的原因。二是，某些制藥機械本身材質不耐高溫，易腐蝕，穩定性差，容易在長期的使用過程中分化出有害物質融入到藥品中。
造成這種現象的根本原因不在于是否應該引進技術、是否應該仿制，而是在于如何正確地看待技術研發。我國制藥機械制造行業有待建立科學技術是核心競爭力的發展觀念，不在乎今天能夠賺取多少利潤，而應該在乎如何能更好地滿足用戶。當把滿足用戶需求放在第一位，用戶自然會慢慢變多，企業自然會慢慢變大、變強。我國制藥機械制造行業應緊緊把握市場的需求，積極研發適應市場需求的技術和產品，打造自己的核心競爭力。
此外，中國制藥機械設備網特邀專家建議企業要注重安全與衛生生產事關消費者的健康，是制藥機械產業的至關重要所在，而機械與設備的衛生設計則是產品安全的首要因素之一。因此，設備的每一個部件都必須達到不積存產品殘留物、土壤或微生物，并易于清潔的標準，這是消除微生物危害的唯一途徑。同時，在生產和包裝全過程中采取控制和檢查措施，也是重要的安全保證。必要時，必須確保產品的可追溯性。為便于流程跟蹤，應對控制和工廠數據進行保存。所有這些舉措都將提升產品安全性。
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